Для защиты от хищников головоногие выпускают «чернильную бомбу» и устраивают своеобразную «дымовую завесу», под прикрытием которой уходят от погони. Темную жидкость для своих "бомб" - так называемые «чернила», вырабатывает у них особый орган, называется он — "чернильный мешок". Мешок имеет форму груши и располагается в кишечнике головоногих в виде своеобразного выроста (в прямой кишке). По своей структуре мешок - двухобъемный, камеры, из которых он состоит, располагаются одна под другой. В верхней камере сохраняются в боевой готовности чернила, а в нижней полости находится "производство чернил". Вырабатываются чернила специальными железами, расположенными в большом количестве в нижней камере, ткань желез состоит из специальных клеток - в составе, которых содержатся зерна этой темной чернильной жидкости. Выработанные чернила поступают в верхнюю часть мешка, и когда хозяину грозит серьезная опасность, он выстреливает порцию чернил, тем самым отпугивая от себя хищника. В момент опасности не все содержимое чернильного мешка используется за один раз. Обычно его запасов хватает на 5–7 залпов. Цвет у чернил разный — у каракатиц он черный с легким синим оттенком, у осьминогов — абсолютно черный, а у кальмаров — черно-коричневый. Темный цвет чернилам придает органическая "краска" из группы меланинов, ее состав очень близок к составу пигмента, содержащегося в волосах млекопитающих и придающего им темный цвет.

Одно время, люди пытались применить свойство каракатиц отпугивать хищников чернилами в своих целях. Метод был основан на обмазывании людей чернилами (в том числе и чернилами каракатиц), из-за которых акулы должны были не нападать на людей. Но в природе все оказалось гораздо сложнее. Более детальные исследования головоногих показали, что выпущенные чернила растворяются в воде не сразу. Как правило, они в течение десяти и более минут, висят в толще воды небольшой темной каплей, и растворяется эта капля только в том случае, если на что-нибудь наткнется. Самым интересным является то, что форма такой капли напоминает по очертаниям форму тела своего хозяина, выпустившего ее. Атакующий хищник, в погоне за моллюском, ошибаясь, хватает эту каплю вместо жертвы, тогда-то темный сгусток и «взрывается», в результате он окутывает врага «дымовой завесой». За такое свойство чернильный двойник моллюска называли "чернильной бомбой". Еще одной особенностью чернил моллюсков является их достаточно едкий состав — благодаря этому свойству они вызывают временную потерю ориентации у хищника не только из-за плохой видимости в «дымовой завесе», но еще и за счет сильного раздражения глаз и органов обоняния. Оказывается и это еще не все! Головоногие моллюски, перед тем как выпустить свою бомбу, меняют свой цвет! Они становятся очень темными и только после этого выпускают торпеду со своим чернильным двойником. Далее они резко бледнеют и почти невидимые убегают. Хищник натыкается на фантом моллюска, получает своеобразный шокирующий удар и теряет моллюска их виду. Моллюск спасен! Таким образом, исследования показали, что "эффект чернил" основан не только на дезоринтировании нападающего, но усиливается еще резкой сменой окраски тела моллюска, и также сильного химического воздействия чернил на органы обоняния хищника. Немаловажен и эффект отработанного тысячелетиями трюка-перевоплощения.

После этих сложных исследований, применение эффекта каракатиц во благо человека оказалось практически невозможным, от метода отказались из-за его структурной сложности.